প্রধান বিষয়বস্তু এড়িয়ে যান

GLFT-অর্থায়িত গবেষকরা SNP ডেটার অগ্রিম ব্যবহার

লেক স্টার্জন (অ্যাসিপেনসার ফুলভেসেনস) গ্রেট লেক জুড়ে একটি পরিবেশগত এবং সাংস্কৃতিকভাবে উল্লেখযোগ্য প্রজাতি। তবুও, জনসংখ্যা ঐতিহাসিক মাত্রার এক শতাংশে অনুমান করা হয়েছে একাধিক মানব-সৃষ্ট কারণ যেমন অতিরিক্ত মাছ ধরা, আবাসস্থলের ক্ষতি বা অবক্ষয় এবং বাঁধ থেকে উপযুক্ত বাসস্থানে বাধা। ফলস্বরূপ, লেক স্টার্জনকে মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রের 19টি রাজ্যে বিপন্ন বা হুমকির সম্মুখীন এবং কানাডায় হুমকির মুখে তালিকাভুক্ত করা হয়েছে। সংরক্ষণ জিনোমিক্স গবেষক এবং মৎস্য ব্যবস্থাপকদের জন্য একটি মূল্যবান হাতিয়ার হিসেবে প্রমাণিত হচ্ছে যারা গ্রেট লেকের লেক স্টার্জন ফিশারিকে সঠিকভাবে পরিচালনা ও নিয়ন্ত্রণ করতে আগ্রহী। এই সংস্করণ গবেষণা নোট গ্রেট লেক ফিশারী ট্রাস্ট দ্বারা সমর্থিত লেক স্টার্জনের উপর গবেষণা অবদান হাইলাইট করে।

2015 থেকে 2019 পর্যন্ত, পশ্চিম ভার্জিনিয়া বিশ্ববিদ্যালয়ের ডক্টর অ্যামি ওয়েলশের নেতৃত্বে একটি গবেষণা দল 16টি লেক স্টার্জন স্পন জনসংখ্যার অভিযোজিত জিনগত বৈচিত্র্য অধ্যয়ন করেছে। ইউনিভার্সিটি লাভালের সাথে এরিক নর্মান্ডাউ এবং লুই বার্নাচেজের সাথে ড. ওয়েলশ যোগদান করেছেন, একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (SNPs) ব্যবহার করে এই জনসংখ্যার জেনেটিক বৈচিত্র বিশ্লেষণ করেছেন যাতে নিরপেক্ষ এবং অভিযোজিত পরিবর্তন অন্তর্ভুক্ত ছিল। তারপরে, দলটি লেক স্টার্জনের অভিযোজিত সম্ভাবনা সংরক্ষণে সহায়তা করার জন্য সম্ভাব্য ব্যবস্থাপনা ইউনিটগুলি সনাক্ত করতে অভিযোজিত বৈশিষ্ট্যের মিলের ভিত্তিতে জনসংখ্যাকে গোষ্ঠীবদ্ধ করেছে।

একটি এসএনপি হল ডিএনএ-তে একটি একক বেস অবস্থানে একটি জিনোমিক বৈকল্পিক। একটি জিনোমের এসএনপিগুলি স্বাস্থ্য, রোগ এবং অন্যান্য বৈশিষ্ট্যগুলিকে কীভাবে প্রভাবিত করে তা নির্ধারণ করতে অধ্যয়ন করা যেতে পারে (NHGRI 2022)।

ন্যাশনাল হিউম্যান জিনোম রিসার্চ ইনস্টিটিউট (NHGRI)জিনোমিক এবং জেনেটিক পদের কথা বলার শব্দকোষ

মূল অনুসন্ধান

  • গবেষণা দলটি কিছু জেনেটিক গবেষণায় ব্যবহৃত মাইক্রোস্যাটেলাইটগুলির তুলনায় এসএনপি ডেটা অনেক বেশি রেজোলিউশন এবং অ্যাসাইনমেন্ট পরীক্ষার ক্ষমতা বৃদ্ধি পেয়েছে।
  • দলটি গ্রেট লেকে সাতটি পরিমার্জিত ব্যবস্থাপনা ইউনিটের প্রস্তাব করেছে যা মৎস্য পরিচালকদের দ্বারা মজুদ করার জন্য জনসংখ্যা নির্বাচনকে অবহিত করার জন্য স্পনিং অবস্থান SNP ডেটা এবং ভূগোল ব্যবহার করে।

লেক স্টারজন গবেষণার জন্য উল্লেখযোগ্য ফলাফল

GLFT-সমর্থিত গবেষণা লেক স্টার্জন ইকোলজি এবং সংরক্ষণে জিনোমিক্সের ভূমিকার বৈজ্ঞানিক জ্ঞানকে এগিয়ে নিয়ে যাচ্ছে। লেক স্টার্জন জনসংখ্যা কাঠামোর পূর্ববর্তী বিশ্লেষণগুলি নিরপেক্ষ জেনেটিক ডেটার উপর ভিত্তি করে ছিল, যা জনসংখ্যার গঠন নির্ধারণের জন্য স্থানান্তর এবং জেনেটিক প্রবাহের ভূমিকা ট্র্যাক করে। ডক্টর. ওয়েলশের দল কীভাবে অভিযোজিত বৈচিত্র বিতরণ করা হয় তা বোঝার উন্নতি করেছে। তদ্ব্যতীত, টিম দ্বারা প্রস্তাবিত পরিমার্জিত ব্যবস্থাপনা ইউনিটগুলি, যদি কার্যকর করা হয়, তাহলে হ্রদের স্টার্জন জনসংখ্যার অভিযোজিত সম্ভাবনার সংরক্ষণ হতে পারে, যা সংরক্ষণ জেনেটিক্সের একটি প্রাথমিক লক্ষ্য।

গবেষণা Spinoff

গবেষণা দল এবং অন্য GLFT-সমর্থিত গবেষক, ডক্টর ওয়েসলি লারসন, আগে উইসকনসিন-স্টিভেনস পয়েন্টের এবং এখন ন্যাশনাল ওশেনিক অ্যান্ড অ্যাটমোস্ফিয়ারিক অ্যাডমিনিস্ট্রেশনের মধ্যে সহযোগিতার মাধ্যমে, ভবিষ্যতের অ্যাসাইনমেন্ট টেস্টিং এবং প্যারেন্টেজ বিশ্লেষণের জন্য 258টি SNP সমন্বিত একটি প্যানেল তৈরি করেছে। এই প্রকল্প থেকে উত্পন্ন তথ্য ব্যবহার করে. গ্রেট লেক ফিশ অ্যান্ড ওয়াইল্ডলাইফ রিস্টোরেশন অ্যাক্ট স্পিনঅফ প্রকল্পের অর্থায়ন করেছে।

আরও জানুন

এই গবেষণা সম্পর্কে আরও তথ্যের জন্য, হুইটেকার, জাস্টিন, লুকাস প্রাইস, জেমস বোস, লুই বার্নাচেজ এবং অ্যামি ওয়েলশ দেখুন। অক্টোবর 2020। "জিনোমিক্সের যুগে সূক্ষ্ম-স্কেল জনসংখ্যার কাঠামো সনাক্ত করা: গ্রেট লেকগুলিতে লেক স্টারজনের একটি কেস স্টাডি।" মৎস্য গবেষণা 230: 105646.

প্রশ্নের জন্য, প্রাথমিক তদন্তকারীর সাথে যোগাযোগ করুন, অ্যামি ওয়েলশ, পিএইচডি, [email protected].

দাবিত্যাগ

গবেষণা নোট GLFT-অর্থায়নকৃত প্রকল্পগুলির ফলাফলগুলি অন্তর্ভুক্ত করে যা গ্রেট লেক মৎস্য চাষকে ঘিরে বৈজ্ঞানিক জ্ঞানের অংশে অবদান রাখে। গবেষকের ফলাফল এবং অনুদানের ফলাফলের সারাংশ GLFT দ্বারা অনুমোদন বা অবস্থান গঠন করে না এবং প্রকল্পের ফলাফল সম্পর্কে সচেতনতা বাড়াতে এবং গবেষক ও মৎস্য ব্যবস্থাপকদের প্রাসঙ্গিক তথ্য সরবরাহ করার জন্য সরবরাহ করা হয়।

তথ্যসূত্র

ন্যাশনাল হিউম্যান জিনোম রিসার্চ ইনস্টিটিউট (NHGRI)। মে 10, 2022। "একক নিউক্লিওটাইড পলিমরফিজম (SNPs)।" Genome.gov. 11 নভেম্বর, 2022 এ অ্যাক্সেস করা হয়েছে। https://www.genome.gov/genetics-glossary/Single-Nucleotide-Polymorphisms

bn_BDBengali