GLFT-finanzierte Forscher entwickeln Nutzung von SNP-Daten weiter
See-Stör (Acipenser fulvescens) sind eine ökologisch und kulturell bedeutende Art in den Großen Seen. Dennoch werden die Populationen auf ein Prozent des historischen Niveaus geschätzt, was auf mehrere vom Menschen verursachte Gründe wie Überfischung, Verlust oder Verschlechterung des Lebensraums und die Barrieren geeigneter Lebensräume durch Staudämme zurückzuführen ist. Infolgedessen wird der See-Stör in 19 US-Bundesstaaten als gefährdet oder bedroht und in Kanada als bedroht eingestuft. Die Naturschutzgenomik erweist sich als wertvolles Instrument für Forscher und Fischereimanager, die die See-Störfischerei in den Großen Seen ordnungsgemäß verwalten und regulieren möchten. Diese Ausgabe von Forschungsnotizen hebt Forschungsbeiträge zum See-Stör hervor, die vom Great Lakes Fishery Trust unterstützt werden.
Von 2015 bis 2019 untersuchte ein Forschungsteam unter der Leitung von Dr. Amy Welsh von der West Virginia University die adaptive genetische Vielfalt von 16 Laichpopulationen des Seestörs. Dr. Welsh analysierte zusammen mit Eric Normandeau und Louis Bernatchez, beide von der Université Laval, die genetischen Variationen dieser Populationen mithilfe von Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs), die neutrale und adaptive Variationen umfassten. Anschließend gruppierte das Team die Populationen anhand von Ähnlichkeiten in adaptiven Merkmalen, um potenzielle Managementeinheiten zu identifizieren, die dazu beitragen sollen, das Anpassungspotenzial des Seestörs zu erhalten.
”Ein SNP ist eine genomische Variante an einer einzelnen Basenposition in der DNA. SNPs in einem Genom können untersucht werden, um festzustellen, ob und wie sie Gesundheit, Krankheiten und andere Merkmale beeinflussen (NHGRI 2022).
Nationales Institut für Humangenomforschung (NHGRI)Sprechendes Glossar genomischer und genetischer Begriffe
Wichtige Erkenntnisse
- Das Forschungsteam stellte fest, dass die SNP-Daten eine viel höhere Auflösung und größere Aussagekraft bei Zuordnungstests boten als die in einigen genetischen Forschungsarbeiten verwendeten Mikrosatelliten.
- Das Team schlug sieben verfeinerte Managementeinheiten für die Großen Seen vor, die SNP-Daten und geografische Angaben zu Laichorten verwenden, um den Fischereimanagern bei der Auswahl der Populationen für die Besatzmaßnahmen zu helfen.
Wichtige Ergebnisse für die See-Störforschung
Die von der GLFT unterstützte Forschung erweitert das wissenschaftliche Wissen über die Ökologie des Seestörs und die Rolle der Genomik beim Artenschutz. Frühere Analysen der Populationsstruktur des Seestörs basierten auf neutralen genetischen Daten, die die Rolle von Migration und genetischer Drift zur Bestimmung der Populationsstruktur verfolgten. Dr. Welshs Team verbesserte das Verständnis der Verteilung adaptiver Variationen. Darüber hinaus könnten die vom Team vorgeschlagenen verbesserten Managementeinheiten, wenn sie umgesetzt werden, zur Erhaltung des Anpassungspotenzials der Seestörpopulationen führen, einem Hauptziel der Artenschutzgenetik.
Forschungsausgründung
In Zusammenarbeit zwischen dem Forschungsteam und einem weiteren von GLFT unterstützten Forscher, Dr. Wesley Larson, der zuvor an der University of Wisconsin–Stevens Point und jetzt bei der National Oceanic and Atmospheric Administration tätig war, wurde ein Panel aus 258 SNPs für zukünftige Zuordnungstests und Abstammungsanalysen entwickelt, wobei die im Rahmen dieses Projekts generierten Daten verwendet wurden. Das Spin-off-Projekt wurde durch den Great Lakes Fish and Wildlife Restoration Act finanziert.
Mehr erfahren
Weitere Informationen zu dieser Forschung finden Sie bei Whitaker, Justine, Lucas Price, James Boase, Louis Bernatchez und Amy Welsh. Oktober 2020. „Erkennung feinskaliger Populationsstrukturen im Zeitalter der Genomik: eine Fallstudie über See-Störe in den Großen Seen.“ Fischereiforschung 230: 105646.
Bei Fragen wenden Sie sich bitte an die leitende Forscherin, Dr. Amy Welsh. [email protected].
Haftungsausschluss
Forschungsnotizen enthält die Ergebnisse von GLFT-finanzierten Projekten, die zum wissenschaftlichen Wissen über die Fischerei in den Großen Seen beitragen. Die Forschungsergebnisse und Zusammenfassungen der Förderergebnisse stellen keine Billigung oder Stellungnahme der GLFT dar und werden bereitgestellt, um das Bewusstsein für Projektergebnisse zu schärfen und Forschern und Fischereimanagern relevante Informationen bereitzustellen.
Verweise
Nationales Institut für Humangenomforschung (NHGRI). 10. Mai 2022. „Einzelnukleotidpolymorphismen (SNPs)“. ^ "Genome.gov - Genome.gov". Zugriff am 11. November 2022. https://www.genome.gov/genetics-glossary/Single-Nucleotide-Polymorphisms