Investigadores financiados por GLFT promueven el uso de datos de SNP
Esturión de lago (Acipenser fulvescens) son una especie de importancia ecológica y cultural en los Grandes Lagos. Sin embargo, se ha estimado que las poblaciones están en un uno por ciento de los niveles históricos debido a múltiples razones causadas por el hombre, como la sobrepesca, la pérdida o degradación del hábitat y las barreras para un hábitat adecuado debido a las represas. En consecuencia, el esturión de lago está clasificado como en peligro o amenazado en 19 estados de EE. UU. y como amenazado en Canadá. La genómica de la conservación está demostrando ser una herramienta valiosa para los investigadores y los administradores pesqueros interesados en gestionar y regular adecuadamente la pesca del esturión de lago en los Grandes Lagos. Esta edición de Notas de investigación Destaca las contribuciones de la investigación sobre el esturión de lago apoyada por el Great Lakes Fishery Trust.
De 2015 a 2019, un equipo de investigación dirigido por la Dra. Amy Welsh de la Universidad de Virginia Occidental estudió la diversidad genética adaptativa de 16 poblaciones de esturión de lago en desove. La Dra. Welsh, junto con Eric Normandeau y Louis Bernatchez, ambos de la Universidad Laval, analizaron las variaciones genéticas de estas poblaciones utilizando polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) que incluían variación neutra y adaptativa. Luego, el equipo agrupó las poblaciones en función de las similitudes en los rasgos adaptativos para identificar posibles unidades de gestión destinadas a ayudar a conservar el potencial adaptativo del esturión de lago.
”Un SNP es una variante genómica en una única posición de base en el ADN. Los SNP de un genoma se pueden estudiar para determinar si influyen en la salud, la enfermedad y otros rasgos y de qué manera (NHGRI 2022).
Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (NHGRI)Glosario parlante de términos genómicos y genéticos
Principales hallazgos
- El equipo de investigación descubrió que los datos de SNP proporcionaban una resolución mucho mayor y un mayor poder de prueba de asignación que los microsatélites utilizados en algunas investigaciones genéticas.
- El equipo propuso siete unidades de gestión refinadas en los Grandes Lagos que utilizan datos de SNP sobre la ubicación de desove y la geografía para informar la selección de la población para la repoblación por parte de los administradores pesqueros.
Resultados significativos para la investigación sobre el esturión de lago
La investigación apoyada por GLFT está impulsando el conocimiento científico de la ecología del esturión de lago y el papel de la genómica en la conservación. Los análisis anteriores de la estructura de la población del esturión de lago se basaron en datos genéticos neutrales, que rastrean los roles de la migración y la deriva genética para determinar la estructura de la población. El equipo del Dr. Welsh mejoró la comprensión de cómo se distribuye la variación adaptativa. Además, las unidades de gestión refinadas propuestas por el equipo, si se implementan, pueden dar como resultado la conservación del potencial adaptativo de las poblaciones de esturión de lago, un objetivo principal de la genética de la conservación.
Investigación derivada
El equipo de investigación colaboró con otro investigador apoyado por GLFT, el Dr. Wesley Larson, que anteriormente trabajaba en la Universidad de Wisconsin-Stevens Point y ahora trabaja en la Administración Nacional Oceánica y Atmosférica (NOAA), y desarrolló un panel compuesto por 258 SNP para futuras pruebas de asignación y análisis de paternidad utilizando datos generados a partir de este proyecto. La Ley de Restauración de la Pesca y la Vida Silvestre de los Grandes Lagos financió el proyecto derivado.
Más información
Para obtener más información sobre esta investigación, consulte Whitaker, Justine, Lucas Price, James Boase, Louis Bernatchez y Amy Welsh. Octubre de 2020. “Detección de la estructura poblacional a escala fina en la era de la genómica: un estudio de caso del esturión de lago en los Grandes Lagos”. Investigación pesquera 230: 105646.
Si tiene preguntas, comuníquese con la investigadora principal, Amy Welsh, Ph.D., [email protected].
Descargo de responsabilidad
Notas de investigación Incluye los resultados de los proyectos financiados por GLFT que contribuyen al conjunto de conocimientos científicos sobre la pesca en los Grandes Lagos. Los hallazgos de los investigadores y los resúmenes de los resultados de las subvenciones no constituyen un respaldo ni una posición de GLFT y se proporcionan para aumentar la conciencia sobre los resultados del proyecto y proporcionar información relevante a los investigadores y a los administradores de la pesca.
Referencias
Instituto Nacional de Investigación del Genoma Humano (NHGRI). 10 de mayo de 2022. “Polimorfismos de un solo nucleótido (SNP)”. Genoma.gov. Consultado el 11 de noviembre de 2022. https://www.genome.gov/genetics-glossary/Single-Nucleotide-Polymorphisms