Cartographie de l'arbre généalogique du cisco des Grands Lacs

Les outils du 21e siècle peuvent-ils aider à la reprise de Cisco ?

L'histoire de Cisco des Grands Lacs, Cisco Corégone, et sa gestion est longue et variée et, heureusement, elle n'est pas terminée. Historiquement, ce poisson d'eau profonde était le principal poisson fourrage de la chaîne alimentaire des Grands Lacs et soutenait les pêcheries commerciales du lac Michigan au lac Ontario. En raison de la surpêche, de la perte d'habitat et de l'introduction d'espèces envahissantes, certaines espèces de cisco ont disparu de certaines parties de leur aire de répartition historique et d'autres ont vu leur abondance diminuer. Des mesures de gestion et de restauration de grande envergure ont été entreprises par des agences tribales, étatiques et fédérales aux États-Unis et au Canada. L'abondance du cisco semble augmenter, ce qui suscite l'intérêt de certains groupes pour le rétablissement des populations perdues.

L’une des lacunes majeures dans les efforts de conservation et de restauration du cisco est la taxonomie du cisco, qui permet de définir les unités de conservation appropriées pour les gestionnaires des pêches. Les progrès de la génomique permettent d’étudier les bases génétiques de l’adaptation du cisco, ce qui n’était pas possible il y a dix ans à peine. De nouvelles recherches utilisant des outils génomiques pour clarifier la structure et la taxonomie de la population du cisco fournissent des informations intéressantes qui remettent en question la compréhension actuelle de l’arbre généalogique du cisco des Grands Lacs.

Les résultats apportent un nouvel éclairage sur la taxonomie Cisco

La théorie dominante de la taxonomie du cisco est que les espèces de cisco ont évolué dans les lacs et que toute différenciation entre les espèces ou les formes est basée sur l'environnement lacustre dans lequel elles vivent. Grâce à cette compréhension, les scientifiques et les gestionnaires des pêches s'attendraient à ce que le cisco puisse être stocké dans un environnement particulier et que le poisson s'y adapte. Avec le soutien du GLFT, une équipe de recherche dirigée par Wesley Larson, anciennement du US Geological Survey et de la Wisconsin Cooperative Fishery Research Unit du College of Natural Resources de l'Université du Wisconsin-Stevens Point, et Amanda Ackiss, également anciennement de l'unité de recherche, ont remis en question cette hypothèse de manière à contribuer à préserver la diversité du cisco et à éclairer le rétablissement de la pêche.

L’équipe de recherche comprenait également Wendylee Stott, du Great Lakes Science Center et de l’Université d’État du Michigan; Julie Turgeon, de l’Université Laval, Québec, Canada; Kevin Donner, de la bande indienne des Odawas de Little Traverse Bay; et Jory Jonas, du Michigan Department of Natural Resources. L’objectif principal de l’étude était d’utiliser des méthodes génomiques pour améliorer la compréhension de la variation génétique entre les différentes formes de cisco. Les travaux financés par le GLFT faisaient partie d’un effort beaucoup plus vaste visant à mener des recherches génomiques sur le cisco des Grands Lacs.

Quatre formes principales de Cisco ont été étudiées, C. artedi, C. hoyi, C. kiyi et C. zenithicus. Plus précisément, l'équipe a génotypé 30 populations de cisco à l'aide de milliers de marqueurs génétiques en utilisant le séquençage de l'ADN associé à un site de restriction. Ils ont ensuite effectué des analyses génétiques de population pour étudier la structure génétique des lacs et des formes. Enfin, l'équipe a examiné la variation adaptative à travers le génome du cisco à l'aide d'une carte de liaison du cisco récemment créée.

L’étude fournit l’une des premières preuves que les formes de cisco des Grands Lacs sont génétiquement différenciées. L’équipe de recherche a pu différencier les formes de cisco partout où elles se trouvent. De plus, les résultats suggèrent que la divergence entre ces formes semble antérieure à la recolonisation des Grands Lacs, ce qui indique qu’il existe une plus grande différenciation entre les formes qu’entre les lacs. Cette forte différenciation génétique suggère que des unités de conservation distinctes pourraient être construites pour chaque forme, ce qui constituerait une stratégie différente de l’approche actuelle qui favorise la préservation des environnements.